1. Өкпе және тыныс алу жолдарының аурулары.

Ағзадағы темекі шегуден негізгі зиян тыныс алу жүйесіне келеді. Зиянды заттар тыныс алу жолдарының ұлпаларын зақымдайды, кеңірдектің кірпігінің жұмысын баяулатады. Шайырлар өкпе альвеолдарында жабысып, бұл газ алмасу алаңының азаюына әкеледі. Азот оксиді бронхты тарылтады, тыныс алуды қиындатады. Нәтижесінде барлық жұтылатын заттар мен микроорганизмдер қанға сіңетін және бүкіл ағзаға таралатын өкпе тіндерінде тұрады. Темекі шегу бронх демікпесінің, созылмалы риниттің, туберкулездің, өкпенің созылмалы ауруларының (бронхиттің және т.б.) дамуын немесе асқынуын тудырады, сондай-ақ суық тию, тұмау аурушаңдығының жиілігін арттырады.

2. Жүрек-қантамыр жүйесі аурулары және ас қорыту органдарының патологиясы.

Тыныс алу мүшелерінен басқа темекі шегуден ағзаның басқа мүшелері мен жүйелері зардап шегеді, жүрек-қантамыр жүйесі ауруларын тудырады. Никотин қан тамырларының тарылуына ықпал етеді, бұл уақыт өте келе аяқ-қолдың ұсақ капиллярларының жарылуына әкеледі; темекіге құмарлықтың теріс салдары бронхтардың, өкпенің, кеңірдектің, көмейдің, өңештің, қуықтың және ұйқы безінің онкологиялық аурулары; ас қорыту органдарының патологиясы (тоқ ішектің полипінің түзілуі, асқазан мен он екі елі ішектің жарасы, гастриттер, колиттер — ішектің шырышты қабыну және т.б.); ауыз қуысының аурулары. Темекі шегудің салдары тек эмаль сарғаю ғана емес, сондай-ақ ойық жара гингивит, пародонтит, шырышты қабықтың онкологиялық зақымдануы  сияқты елеулі патологиялар болуы мүмкін.

3. Темекі шегу сіңірлер мен байламдарға, тірек-қимыл аппаратының бұзылуы сондай-ақ бұлшықет тініне зиянды әсер етеді.

Ағзада темекі шегудің әсерінен кальцийдің сіңірілуі нашарлайды, остеопороз дамиды, сыну жиілігі және ревматоидты артрит және басқа аурулар (ІІ типті қант диабеті, депрессия, шашыраңқы склероз, есту қабілетінің бұзылуы және т. б.) артады.)